Zusätzlich zu der angenommenen Wirkungsweise (Zerstörung der Membran) wurde festgestellt, dass Polyhexanide (PHMB) in Bakterienzellen eindringt und an die DNA bindet, was letztlich zum Zelltod führt. In Säugetierzellen erreicht PHMB die DNA nicht. Aufgrund der besonderen Wirkungsweise ist eine bakterielle Resistenz gegen PHMB unwahrscheinlich.